ich versteh zwar deine Frage nicht, aber denke es zu ahnen was du willst
vielleicht hilft dier diese funktion weiter:
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int strcmp ( string str1, string str2)
Returns < 0 if str1 is less than str2; > 0 if str1 is greater than str2, and 0 if they are equal.
Note that this comparison is case sensitive.
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beachte, dass du auch noch zeilenweise durch deine beiden textdateien 'druchsteppen' solltest um die einzelnen Zeilen zu vergleichen.