Da es bei deiner Anwendung nicht wirklich auf die Sicherheit der Hash-Funktion ankommt würde ich es doch einfach mal testen. Mit einer guten Mischung unterschiedlich großer dateien, einfach mal jede Hash funktion durchlaufen lassen und manual oder via batch die Zeit messen.
google spuckt wegen collision folgendes aus
http://www.nationmaster.com/encyclop...e-verification


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