ich hab das unter w2k mal an einer kleinen Partition (mit vorheriger Sicherung

) ausprobiert.
hab' das mit dem entsprechenden Windows-Tool gemacht und hat fehlerfrei funktioniert

(dauert aber etwas ...)
danach habe ich (ohne Sicherung

) auch die anderen Partitionen fehlerfrei konvertiert.
FAT32 hat schnelleren Datenzugriff beim Lesen als NTFS, NTFS gilt aber als sichererer beim Schutz vor datenverlust bei Programm-Abstürzen ...
wenn du ggf. noch weitere Rechner mit älteren Windows-Versionen im LAN hast, solltest du vielleicht bei FAT32 bleiben. win9x kann mit NTFS nix anfangen, weder lesen noch schreiben.
oder du greifst ausschließlich vom w2k/XP-Rechner auf die älteren zu, das funktioniert auch mit NTFS