Naja, die Frage ist generell erstmal - welche Daten du sichern möchtest. Du kannst z.b. nicht einfach mal kurz das Laufwerk c: auf den USB Datenträger kopieren.
Das Problem ist nämlich, dass du nur Dateien kopieren / bearbeiten / löschen kannst, die zur Zeit nicht verwendet werden. Problem ist dort z.b., dass Windows selbst ja läuft und seinerseits hunderte Datien gelockt hat, die du natürlich nicht kopieren kannst. Ich nehm mal an, dort wird auch dein Fehler liegen...
Da gibt es extra Programme, z.b. Nortons Ghost, mit der du eine 1 zu 1 Kopie deiner Festplatten erstellen kannst. Dieses Programm startet den Rechner für den Kopiervorgang schlichtweg neu und bootet nicht Windows, sondern eine eigene PC Dos Umgebung, von der das Programm zugriff auf jede Datei hat (da Windows ja nicht geladen ist).
Sollte das aber nicht das Problem sein, kannst du auch einfach mal Scandisk laufen lassen (Laufwerk reparieren), sobald er gelockte Dateien findet, bootet er den Rechner neu und fährt während dem bootvorgang von Windows mit dem reparieren fort.
Falls es wirklich defekte Dateien sind (Deiner Meinung nach es also nicht am dem oben beschriebenen Problem liegt), kannst du auch einfach in die Command Line gehen und mit
Code:
chkdsk Laufwerksbuchstabe: /R /X
eintippen, danach wird er das komplette Laufwerk nach Fehlern und sonstiges durchsuchen. Wobei Dateien in der Regel nicht einfach kaputt gehen^^