Ohne Gewähr: Leider find ich spontan jetzt keine offizielle Definition der Rechnungsnummer aber soweit ich das im Kopf hab, war der Sinn der Rechnungsnummer, dass die Rechnung "identifizierbar" wird. So lang du keine Nummern doppelt vergibst sollte es eigentlich kein Problem geben. Wie du sie gestaltest bleibt dir überlassen.
In der Steuersammlung hier im Forum findet sich folgende Datei:
http://www.tt-wagenfeld.de/ust/rechnung.pdf
Darin steht ebenfalls nur, DASS eine Rechnungsnummer vergeben werden muss zur Identifizierung. Also stell dein System jetzt einmal um und dann mach fortlaufende Rechnungsnummern
2006-1-1
2006-1-2
2006-1-3 usw
und
2006-2-1
2006-2-2
2006-2-3 usw